在击败了 puppies.co 的阴谋多年后，宝贝老板——现在是少年蒂姆的弟弟——已经成长为一名出色的特工。一天，全球所有被称为“宝可梦”的生物突然觉醒了人类语言能力，集体罢工抗议“被人类奴役抓捕”。宝贝老板所在的宝宝公司派出精英小队调查，发现幕后策划者竟是上一任宝贝老板——一位因工作失误被开除、如今沉迷于《宝可梦》游戏、试图用虚拟规则改造现实世界的中年大叔。宝贝老板不得不与变成话痨的皮卡丘、杰尼龟等角色联手，进入一款被篡改的宝可梦游戏本体，在那里，他们必须击败一只由怨念代码构成的超梦。而最终的真相是：所有宝可梦其实都是某个被遗忘的孩子的想象力造物。
这部恶搞与致敬并存的动画片是送给千禧一代的怀旧礼物。笑点密集且分两层——孩子看热闹，成人看出走半生归来仍是宝可梦训练师的荒诞感。配音阵容豪华，反派的动机甚至让人恨不起来。片尾彩蛋狂喜。
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